舞台是19世纪末。 阿尔比恩王国由于共和革命而分裂。 被巨大的墙壁分断的首都伦敦，东侧由王国、西侧由共和国统治，成为各国间谍活跃的暗影战争最前线。 革命之后10年，王国名门梅菲尔女王校出现了以女高中生为伪装、身为共和国间..

本作为大家描述在母港里生活的各位舰船的日常生活。 一句话剧情这是个冠上舰船名称的少女们所生活的世界，而且与「现在」的世界有点不同。 她们隶属于许多势力同心协力组成的联合组织「碧蓝航线」。 舰船们都在设置于母港里的「学园」..

平凡な少年・加賀見かずやの前に、 付喪神の美少女・桐葉が現れてから、これまでの生活は一変した。 怪異を呼び寄せる「忌み子」であったかずやは、 土地の神・くくりから怪異を倒す「すそはらい」の命を受け..

为碧蓝的航线献上祝福！「碧蓝航线」的少女们，击退了从世界之外而来的神秘敌人「塞壬」的大攻势。但，战争不管到了何时，都不会有变化。正如当初人类争夺海上霸权一般，「碧蓝航线」与「赤色中轴」因理念不同而对立。之后，时光流逝......