神话时代，宙斯之子亚伯妄想统治大地，他自称太阳神，张扬跋扈不可一世，最终遭到宙斯和阿波罗的抹杀。 数千年后，亚伯复活，假上天之名欲淹没人类文明，重建众神世界。 他邀请雅典娜和其共同统领世界，并用神力复活战死的黄金圣斗士。 ..

不祥之夜，四道邪恶光芒侵入圣域，以迅雷不及掩耳的速度击倒多名黄金圣斗士。 来者乃圣魔天使，是堕落天使路西法的手下。 神话时代，路西法试图凌驾众神之上，最终被打入魔界。 他怀着恐怖罪恶的念头复活，凭借堕入魔界的波塞冬、艾丽..

一年一度的七夕即将到来，东京、神奈、静冈、长野等地却接连发生六起连环杀人案，被害者身边皆留下麻将牌中的七筒和奇怪暗示。 由于作案范围过大，各地警署探员纷纷聚到东京警署的专案组共同研究案情，毛利小五郎也被邀请参加，柯南则偷偷听取了会议..

进入21世纪已有近20年，在人们已忘记了妖怪存在的现代。科学无法解明的现象频发，流言飞语散布各处，大人们只能疲于奔命。希望想办法解决这一情况而写信给妖怪信箱的13岁少女真奈的面前，随着咔哒咔哒的木屐响声，鬼太郎来到了。

战国时代，号称霸王的织田信长，在现代日本复活了。但，却是以柴犬的样貌！与信长同时代的战场名将们，也全都转生成了狗。现代的群雄割据，是在遛狗场中