《移动迷宫3》作为系列最终章，沿袭系列一贯以来的劲爆动作戏和快节奏跑酷风，讲述托马斯率领的好莱坞跑男团在经历了迷宫逃脱和末日丧尸的生死考验后，终于迎来最后的正邪较量。

男孩托马斯在电梯中醒来，奇怪的是他除了名字之外什么都记不得。 当电梯打开，他来到了一个陌生的地方林间空地。 这里四周被高大的石头墙包围着，墙内住着许多男孩，有纽特、查克、米诺等人，他们都被困在迷宫里，而墙外还有一群巨大的怪兽威..

托马斯、米诺一行人被带到一座神秘的庇护所，这个机构由表里不一的詹森所管理，詹森为他们提供安稳且舒适的环境，并下令让幽地斗士们在医疗实验室中接受一连串的测试，詹森向托马斯保证将会把他们送到更加安全的保护区与其他对闪焰症病毒免疫的年轻人一同居..