炎热的暑假到来，忍术学校一年叶组的好伙伴乱太郎、雾丸和新兵卫留在学校，度过了无忧无虑的快乐假期。

谁知假期即将结束，他们的作业还没完成，因此也随之焦急起来。

某天，学园长大川平次涡正的老朋友锻刀师六道辻卫门找上门来求助，原来辻卫门打造的妖刀极乐丸被木耳城的切羽拓郎盗走。

传说谁得到这柄妖刀，就可实现称霸天下的野望。

居心叵测的切羽将极乐丸交给毒竹忍者队的首领稗田八方斋，并怂恿后者铲除挡在前面的忍术学校。

园长得知这一消息，鼓励乱太郎他们夺回极乐丸，以此作为暑期的实习内容。

小小忍蛋，能否完成这个事关天下的重任？